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- A multilocus comparative study of nucleotide variation in Drosophila madeirensis and the close relative D. subobscura: insights into the speciation process of D. madeirensisPublication . Nóbrega, Clévio David Rodrigues; Segarra, Carmen; Khadem, MahnazO estudo da divergência entre espécies relacionadas, utilizando dados de vários loci é uma das formas de estudar a especiação e permite distinguir as forças que actuam em todo o genoma daquelas, como por exemplo a selecção natural, que afectam apenas os loci individualmente. Assim sendo, um dos grandes objectivos deste trabalho foi estudar a história da divergência entre duas espécies relacionadas, Drosophila madeirensis e D. subobscura , utilizando dados de sequências de DNA. O polimorfismo das inversões cromossómicas é uma característica comum do genoma do género Drosophila , no qual cerca de 60% das espécies são polimórficas para as inversões pericêntricas em populações naturais. O outro grande objectivo deste trabalho foi estudar o nível de variação nucleotídica em duas diferentes ordenações do cromossoma X de populações de D. subobscura (A2 e Ast). Assim, a análise da variação nucleotídica ao longo da inversão pode indicar o papel desempenhado pela selecção natural na formação e manutenção dos polimorfismos cromossómicos. Para atingir estes dois principais objectivos foram estudadas cinco regiões (que se distribuíam ao longo da inversão A2) do cromossoma X. De uma forma geral, o nível de polimorfismo nucleotídico encontrado foi similar nas duas espécies, apesar de D. madeirensis ser uma espécie endémica da ilha da Madeira e as populações de D. subobscura estudadas serem também insulares, e por tal se espera que possuam um tamanho populacional efectivo pequeno. Estimou-se o tempo de divergência entre D. subobscura e D. madeirensis em 640.000 e 1.400.000 anos e o modelo de isolamento sem fluxo génico após a divergência como causa de especiação não foi rejeitado. Em relação ao estudo das ordenações cromossómicas de D. subobscura , verificou-se que existe uma grande diferenciação genética em todas as regiões estudadas entre as duas ordenações. Os dados apontam para a existência de fenómenos de conversão génica e pouca evidência de troca de material genético na parte central da inversão.